Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb4Q02738 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms