Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pax5Q02650 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pax5Q02650 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms