Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GscQ02591 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GscQ02591 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GscQ02591 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms