Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbp1Q01514 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbp1Q01514 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms