Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sec23aQ01405 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec23aQ01405 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms