Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VegfaQ00731 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VegfaQ00731 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms