Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SeleQ00690 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms