Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Irx1P81068 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Irx1P81068 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Irx1P81068 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Irx1P81068 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Irx1P81068 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Irx1P81068 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Irx1P81068 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Irx1P81068 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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