Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms