Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Hoxd13P70217 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Hoxd13P70217 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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