Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps18P62270 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps18P62270 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps18P62270 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms