Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lmo4P61969 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms