Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CirbpP60824 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms