Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcbp1P60335 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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