Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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Cldn18P56857 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Cldn18P56857 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Cldn18P56857 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Cldn18P56857 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Cldn18P56857 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Cldn18P56857 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Cldn18P56857 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Cldn18P56857 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Cldn18P56857 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Cldn18P56857 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn18P56857 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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