Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh3bp1P55194 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sh3bp1P55194 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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