Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NrlP54846 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NrlP54846 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrlP54846 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrlP54846 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrlP54846 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrlP54846 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrlP54846 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrlP54846 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NrlP54846 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrlP54846 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NrlP54846 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrlP54846 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrlP54846 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrlP54846 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrlP54846 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrlP54846 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrlP54846 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrlP54846 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrlP54846 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrlP54846 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrlP54846 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrlP54846 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrlP54846 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrlP54846 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NrlP54846 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NrlP54846 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NrlP54846 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NrlP54846 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NrlP54846 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NrlP54846 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NrlP54846 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NrlP54846 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NrlP54846 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NrlP54846 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NrlP54846 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NrlP54846 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NrlP54846 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NrlP54846 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NrlP54846 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NrlP54846 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NrlP54846 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NrlP54846 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms