Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgd1P52734 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms