Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrprbP47758 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SrprbP47758 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SrprbP47758 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms