Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Tnfsf9P41274 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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