Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TtlP38585 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TtlP38585 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TtlP38585 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TtlP38585 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TtlP38585 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms