Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Znf239P24399 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms