Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd8P23463 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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