Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pde6bP23440 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pde6bP23440 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pde6bP23440 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pde6bP23440 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pde6bP23440 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pde6bP23440 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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