Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klra1P20937 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klra1P20937 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klra1P20937 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klra1P20937 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klra1P20937 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klra1P20937 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klra1P20937 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klra1P20937 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klra1P20937 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Klra1P20937 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klra1P20937 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klra1P20937 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klra1P20937 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klra1P20937 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klra1P20937 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klra1P20937 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klra1P20937 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klra1P20937 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klra1P20937 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klra1P20937 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klra1P20937 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klra1P20937 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klra1P20937 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Klra1P20937 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Klra1P20937 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klra1P20937 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klra1P20937 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klra1P20937 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klra1P20937 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klra1P20937 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms