Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P18529 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
P18529 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P18529 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
P18529 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms