Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpraP18052 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtpraP18052 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PtpraP18052 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PtpraP18052 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PtpraP18052 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpraP18052 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms