Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp53P15975 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp53P15975 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp53P15975 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms