Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Tnp1P10856 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms