Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb7P09024 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb7P09024 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms