Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxa5P09021 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms