Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Spta1P08032 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Spta1P08032 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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