Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HbaP01942 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HbaP01942 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HbaP01942 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HbaP01942 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms