Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Stra6O70491 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stra6O70491 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stra6O70491 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Stra6O70491 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Stra6O70491 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stra6O70491 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stra6O70491 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stra6O70491 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stra6O70491 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Stra6O70491 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stra6O70491 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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