Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lnx1O70263 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Lnx1O70263 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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