Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Copb2O55029 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms