Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CrxO54751 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CrxO54751 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CrxO54751 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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