Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FxnO35943 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FxnO35943 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FxnO35943 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FxnO35943 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FxnO35943 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FxnO35943 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FxnO35943 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FxnO35943 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FxnO35943 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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FxnO35943 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FxnO35943 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FxnO35943 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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FxnO35943 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FxnO35943 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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FxnO35943 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FxnO35943 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FxnO35943 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FxnO35943 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FxnO35943 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FxnO35943 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FxnO35943 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FxnO35943 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FxnO35943 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FxnO35943 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FxnO35943 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FxnO35943 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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