Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

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Length 966 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pkd2O35245 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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