Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Eftud2O08810 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms