Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ube3aO08759 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ube3aO08759 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ube3aO08759 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ube3aO08759 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ube3aO08759 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ube3aO08759 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ube3aO08759 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Ube3aO08759 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3aO08759 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ube3aO08759 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ube3aO08759 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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