Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna2d1O08532 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms