Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms