Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20878L7N244 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20878L7N244 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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