Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20939L7N243 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms