Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm20795J3QP49 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm20795J3QP49 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm20795J3QP49 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm20795J3QP49 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm20795J3QP49 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm20795J3QP49 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gm20795J3QP49 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm20795J3QP49 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm20795J3QP49 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Gm20795J3QP49 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm20795J3QP49 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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