Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm11236J3QMS7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm11236J3QMS7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm11236J3QMS7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm11236J3QMS7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm11236J3QMS7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm11236J3QMS7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm11236J3QMS7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm11236J3QMS7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm11236J3QMS7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm11236J3QMS7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm11236J3QMS7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm11236J3QMS7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm11236J3QMS7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm11236J3QMS7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm11236J3QMS7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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