Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm6176J3QK59 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6176J3QK59 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6176J3QK59 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6176J3QK59 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm6176J3QK59 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6176J3QK59 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6176J3QK59 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm6176J3QK59 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6176J3QK59 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm6176J3QK59 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm6176J3QK59 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm6176J3QK59 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6176J3QK59 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6176J3QK59 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6176J3QK59 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm6176J3QK59 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm6176J3QK59 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm6176J3QK59 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm6176J3QK59 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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