Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm17535J3KMR8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm17535J3KMR8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm17535J3KMR8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm17535J3KMR8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm17535J3KMR8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm17535J3KMR8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm17535J3KMR8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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