Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm29394H3BIW7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms